A Faculdade de Educação Teológica de São Paulo oferece os seguintes cursos de Mestrado à distância:
Curso de Mestrado em Teologia Sistemática
Curso de Mestrado em Teologia Prática
Curso de Mestrado em Teologia Bíblica
Curso de Mestrado em Psicologia Pastoral
Curso de Mestrado em Pedagogia Cristã
Curso de Mestrado em Missiologia
Curso de Mestrado em Ministério Pastoral
Curso de Mestrado em Louvor e Adoração
Curso de Mestrado em Filosofia da Religião
Curso de Mestrado em Filosofia Cristã
Curso de Mestrado em Estudos Bíblicos
Curso de Mestrado em Ensino Religioso
Curso de Mestrado em Educação Religiosa
Curso de Mestrado em Divindade
Curso de Mestrado em Direito Eclesiástico
Curso de Mestrado em Ciências da Religião
Curso de Mestrado em Administração Eclesiástica
Curso de Mestrado em Aconselhamento Cristão
Curso de Mestrado em Psicanálise